中山大学有两所独立学院，分别是中山大学南方学院和中山大学新华学院。

中山大学南方学院位于广东省广州市从化市，是一所多学科全日制应用型本科高等学校。学院创建于2006年，2016年被遴选为广东省普通本科转型试点高校。截至2017年，校园占地面积1000亩，图书馆藏书189万册，教学科研仪器设备总值9261万元；共有本科生17755人，继续教育在校生1167人；共有教师816人，其中博士生导师12人。

中山大学新华学院是一所综合性全日制普通高等院校，是中国医学数字教育项目示范基地